葛貫です。
邑瀬さんwrote:
> ところで、タンパク質の高次構造はすべて自動的に決まるのでしょうか？
> つまり、エネルギー的に一番安定な形になっているのかということです。
> 分子シャペロンなどが(タンパク質の折りたたみの場を提供するだけで
> なく)積極的に関与して、二番目や三番目に安定な形に落ち着かせたり
> していないのでしょうか？（←単なる疑問です。）となると、これまた
> 計算機上だけでは対応できなくなります。
不適切な表現でした(^^;;。
生体内（細胞内）の環境が遺伝情報が持っている設定の範囲にあるなら、
プログラム通りに、いくつかの中間段階を経て、「あるべき姿」に落ち着く
ようになっているのだろう、という意味で「自動的に」という言葉を使って
しまいました。
あるひとつのタンパク質ができるには、アミノ酸の「ひも」ができたあと、
金属イオンをとり込んだり、糖鎖等の修飾を受けたり・含硫アミノ酸の
架橋ができたり（これらの反応には、それぞれタンパク質でできている
酵素がかかわっている、複雑(^^；）機能を発現するようになるのですよね。
（誤解していたら、ご指摘下さい。）
ここで、あるはずの物質がなかったり、初期設定にはない物質が存在したり
して、細胞内の環境が遺伝情報がつくられた時の設定とは、異なったものに
なっていたら、違うタンパク質ができてしまうことになりますよね？
DNAの塩基配列の解析だけではなく、酵素反応が起きる細胞内の環境も考え
合わせなければならないんじゃないかなと思って【4015】を書いてみました。
別の話になってしまいますが、「望む機能を持つタンパク質をつくる
ためにアミノ酸配列（DNA塩基配列）をデザインする」というアプローチで
研究をしている方もいらっしゃるようです。
大阪の方だったと思います（^^)。
「阪大、バイオ研究にグリッドコンを初適用」
http://biztech.nikkeibp.co.jp/wcs/show/leaf?CID=onair/biztech/medi/172786
という記事を最近、見かけました。
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